Terra antiquíssima, os primeiros vestígios de ocupação humana remontam à proto-história, presentes no castro de Santa Margarida, monumento que se encontra classificado como Imóvel de Interesse Público. A povoação de S. Tomé de Negrelos aparece já referida no século XI. Esta povoação chegou a ser vila e couto, tendo pertencido ao concelho de Negrelos, o qual depois de extinto, foi integrado no concelho de Santo Tirso.
É digno de visita a Igreja Paroquial, a Capela do Santíssimo Sacramento com abóbada de nós e uma loggia quinhentista, exemplar único na região. È de salientar a presença de várias casas solarengas, como a de Vilela; a do Paço (ambas armoriadas) e a de Leiras e do Ginjo. Não se pode visitar esta freguesia sem percorrer as quintas onde se produz algum do melhor vinho verde da região.
